星間歴０９７９・・・・。
亜空間生命体「ディーヴォ」が侵略を開始した。
彼らの出現により宇宙空間に歪みが生じ、人類が開拓してきた
様々な星系は亜空間にのみこまれていった。
若きガーション＝バートンは、先代の命を受けビックバイパーを駆って出撃。
最後の戦艦ヘルハウンドまで追いつめたが、
さらに巨大な亜空間生命体「ドゥーム」の出現によって撤退を余儀なくされた。
そして「ディーヴォ」は、周辺の星系もろとも
「ドゥーム」にのみこまれていったのである。

星間歴０９９９・・・・。
亜空間生命体「ドゥーム」の野望は、
ビックバイパー、スーパーコブラという、
２機の超時空戦闘機によって打ち砕かれた。

しかし・・・・、

母星グラディウスに向けて帰還の途にあった
ビックバイパー、スーパーコブラとの交信が突然途絶えた。
そして、「ドゥーム」の手によってよみがえった
亜空間生命体「ディーヴォ」の侵略が始まった。
「ディーヴォ」の魔の手から、一刻も早く
ビックバイパーとスーパーコブラを救い出さなければならない。
ビックバイパーにはガーション＝バートンの息子、
ウィル＝バートンが乗っているのだ・・・・。

今、人類最後の希望を賭けて、４機の超時空戦闘機が発進する。
ファイナライザー、カミカゼ、スラッシャー、サーベルタイガー！
発進！！

英訳版